Przede wszystkim dwie rzeczy - atak na Coruscant z porwaniem Palpatine`a (1) oraz misja na Nelvaan Obi-Wana i Anakina (2).
SPOILERY! (pod względem treści akcji bo i tak wszystko skończyło się tak jak w Clone Wars )
Mogę trochę namieszać, bo nie pamiętam tego już za dobrze, sens na pewno będzie dobry
1. Nie pamiętam ze szczegółami jak to było, ale w CW pokazali to tak, że Shaak Ti i 2 Jedi (Mistrzowie Jedi?) przyszli po kanclerza popijającego herbatkę i razem spieprzali przez pół Coruscant. W Labiryncie natomiast do kanclerza została wysłana Shaak Ti i Stass Allie. Z niechęcią poszedł z nimi i Gwardią do jakiegoś bunkra gdzie dołączyło chyba jeszcze 2 Jedi i 2 padawanów (w tym tych dwóch właśnie z CW, ale to taki szczegół). Tam przed bunkrem Allie i Ti zostały zaatakowane i ranione przez MagnaGuards i Grievousa który razem ze swoimi ochroniarzami wszedł do bunkra, wszystkich pociachał i zabrał kanclerza. Ale co się działo z Grievousem w międzyczasie. Otóż działa się jedna z IMHO najlepiej opisanych walk w SW (i jedna z moich ulubionych ), czyli pojedynek Mace Windu vs Grievous na dachu pociągu. Obok jeszcze walczył Kit Fisto z 2 IG-100. IG-100 zostały porąbane na kawałki, natomiast Grievous zrzucony z otchłań piekielną (tzn. w dół ) skądś jakimś cudem uratowała go porwana kanonierka. Podsumowując: Mace nie miażdżył Grievousowi płuc, a Shaak Ti nie została zaplątana w kable. Aha i jeszcze nie było walki Yody i Windu na ulicach Coruscant z robotami. Yoda ani na chwilę nie opuścił stanowiska dowodzenia w świątyni (to też jest nie do wyjaśnienia).
2. Cały Labirynt zła to wpadnięcie na trop i poszukiwanie Dartha Sidiousa (co, tak na marginesie, w końcu im się udało i go znaleźli ). Za detektywów przez większość czasu robią Anakin i Obi-Wan. Byli oni praktycznie cały czas zajęci, akcja w Labiryncie dzieje się non-stop. Nagle pojawia się trop, że na Tythe jest Dooku, więc dzielni wojownicy tam lecą. Dooku faktycznie tam jest, ale robi ich w h**a i ucieka na Coruscant (zgodnie ze swoim, a raczej Sidiousa, planem). Na Tythe Kenobi i Skywalker dostają wiadomość, że Coruscant zostało zaatakowane i muszą wracać. W CW jak wszyscy wiedzą taką informację dostali na Nelvaan. Poza tym jak wspomniałem akcja dzieje się szybko i ja nie wiem gdzie ten Nelvaan wcisnęli, bo wszystko zostało wyjaśnione tak, że najpierw byli na Nelvaanie, a potem polecieli na Tythe.
Koniec spoilerów